生物与化学工程学院源于嘉兴高等专科学校的发酵工程系， 2003年更名为生物与化学工程学院。学院设有如下部门：党政办公室、教务办公室、学生工作办公室，共有三个系：应用化学系、化学与制药工程系、环境与生物工程系。此外还有承担全校实验教学任务的生化工程实验中心、受学校委托管理的校分析测试中心。
学院拥有一支素质过硬、学术造诣较深、富有创新精神、团结协作、爱岗敬业的师资队伍。截至2018年6月，学院拥有教职工120人，专任教师83人，其中国家“千人计划”获得者1人、浙江省钱江特聘教授2人、浙江省中青年学科带头人2人、“南湖学者特聘教授”8人、学校学科带头人10人、具有海外留学背景的教师33人、教授19人、副教授33人、博士生导师3人、硕士生导师22人; 省“新世纪151人才工程”第一层次培养人员1人，第三层次培养人员4人。
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